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Bolsas de integração na investigação

Ano lectivo 2009/2010

Bolsas de Integração na Investigação 2009/2010

No âmbito do Programa Ciência 2008, o ITQB oferece Bolsas de Integração na Investigação (BII) a estudantes do ensino superior (1º ciclo) dos cursos de ciências e tecnologias.

Os estudantes serão integrados num dos laboratórios do ITQB onde participarão num projecto de investigação em curso sob a supervisão  de um investigador doutorado do ITQB. Ao projecto de investigação realizado ao longo de um ano, e após uma avaliação positiva, correspondem 15 ECTS (Curso de Iniciação à Investigação).

As candidaturas, indicando o(s) laboratório(s) a que se candidata, devem ser enviadas até 15 de Junho para bii@itqb.unl.pt.

Ver regulamento.

 

Laboratórios que recebem estudantes do 1º ciclo em 2009/2010

 

  • Laboratório de Biologia de infecção

Os estudantes interessados deverão contactar o coordenador do laboratório para mais informações sobre o trabalho a realizar. Contacts and more info.

 

  • Laboratório de Sinalização Celular em Drosophila

Os estudantes interessados deverão contactar o coordenador do laboratório para mais informações sobre o trabalho a realizar. Contacts and more info.

 

  • Laboratório de Superfícies Celulares e Patogénese Bacteriana

Aceitamos candidaturas de estudantes que usufruindo de uma bolsa de iniciação a investigação, queiram participar nos projectos do nosso grupo de investigação. O candidato irá trabalhar com bactérias de relevância clínica, Streptococcus pneumoniae ou Staphylococcus aureus, com o objectivo de melhor perceber os mecanismos de síntese da parede celular bacteriana. Como estes modelos bacterianos pretendemos também identificar as estratégias que estas e outras bactérias previnem que o seu peptidoglicano seja reconhecido pelo sistema imunitário do hospedeiro. Contacts and more info.

 

  • Laboratório de Química Bio-orgânica

Síntese de derivados do ácido tartárico para a elaboração de novos organocatalisadores: O trabalho consiste na síntese de alguns intermediários derivados do ácido tartárico para a preparação de uma nova classe de catalisadores: os organocatalisadores. Estes novos organocatalisadores serão testados em vários tipos de reacções.

Síntese de derivados de açucares para estudos de estabilização de proteínas: O trabalho consiste na preparação de alguns açucares derivados da manose, glucose e galactose para estudos bioquímicos de estabilização de proteínas. Diferentes tipos de glicosilação envolvendo diversos dadores glicosídicos/condições de reacção serão estudados de modo a optimizar a selectividade anomérica para cada açucar.

Contacts and more info.

 

  • Laboratório de RMN Biomolecular

We have two active projects in the group of Biomolecular NMR: a) Structural and Biochemical characterization of novel Fe2+ metabolic pathways; b) Structural proteomics of thermostable protein libraries by NMR.

In those projects students will be trained in biochemical and biophysical methods. If they are interested they can also use some basic NMR methods. Students with a BII scholarship will work on molecular biology and protein expression in E.coli. They will perform some basic molecular biology techniques such as cloning and gel electrophoresis and work on protein expression and purification followed by basic biochemical methods for protein characterization.

Some of the scientific problems that we are working on in our lab are: the cloning of new proteins, protein biochemistry, protein structure elucidation and dynamics studies, Protein-protein interactions, Metal binding to proteins, paramagnetic NMR, study of large proteins and solid state NMR.

The projects are interdisciplinary and students from many different backgrounds can apply. Students with background in chemistry, biochemistry or biophysics are welcome. Prior knowledge of NMR is not required. Contacts and more info.

 

  • Laboratório de Desenvolvimento Microbiano

Enzymes of the bacterial spore surface: Bacterial spores can remain viable in the environment for periods of time possibly in excess of million of years. Yet, they are able to constantly monitor the environment and resume growth within minutes of exposure to appropriate levels of compounds able to trigger germination. The surface of the spore is punctuated by enzymes that are essential for assessing the potential of the medium to support growth, and also for converting the dormant spore into an actively-dividing vegetative cell. One Project deals with the genetic, biochemical and structural characterization of a surface exposed enzyme that is essential for spore germination. Contacts and more info.

 

  • Laboratório de Biodinâmica de sistemas

A investigação no laboratório Biodinâmica Sistémica está centrada em processos dinâmicos, tais como crescimento ou ritmicidade em sistemas multi-celulares ou organismos inteiros sob condições ambientais complexas. Aplicamos, desenvolvemos e integramos ferramentas computacionais e matemáticas para a análise de dados, modelação e simulação.

Estamos interessados em receber um estudante de licenciatura para analisar e/ou simular o crescimento de biofilmes microbianos, ou a sincronização de ritmos circadianos comportamentais. Outros tópicos surgindo de colaborações com parceiros experimentais no ITQB poderão também ser considerados.

Este projecto requer interesse - e, idealmente, experiência - no uso de métodos computacionais e matemáticos e a sua aplicação a problemas biológicos. O planeamento exacto do projecto será ajustado à investigação em curso conduzida no laboratório e ao perfil específico do potencial candidato. Contacts and more info.

 

  • Laboratório de Biologia Celular Bacteriana

O Laboratório de Biologia Celular Bacteriana aceita candidaturas para Bolsas de Iniciação à Investigação. O trabalho será inserido nos projectos a decorrer no laboratório, em que são estudados os mecanismos de resistência a antibióticos da bactéria patogénica Staphylococcus aureus. Os candidatos têm de ter bons conhecimentos de inglês. Contacts and more info.

 

  • Laboratório de Interacção Molecular e RMN 

A shortened program of training within one of the MSc projects is offered. For more information, please contact the head of laboratory

 

  • Laboratório de Glicobiologia

Os estudantes interessados deverão contactar o coordenador do laboratório para mais informações sobre o trabalho a realizar. Contacts and more info.
 

  • Laboratório de Química de Coordenação e Supramolecular

Os estudantes interessados deverão contactar o coordenador do laboratório para mais informações sobre o trabalho a realizar. Contacts and more info.

 

  • Laboratório de Sintese Orgânica

Uma das vertentes de investigação desenvolvida no Laboratório de Síntese Orgânica no ITQB visa a síntese de compostos naturais e não naturais, com interesse biológico. As vias sintéticas exploradas visam a obtenção de compostos opticamente activos, na forma isomericamente pura. Pretendemos desenvolver estratégias de síntese estereosselectiva de pequenas moléculas, relativamente complexas. Alguns destes projectos são interdisciplinares, envolvendo vários grupos de investigação, no ITQB. Estamos também interessados na síntese de moléculas com impedimento geométrico que seja conducente a propriedades químicas e ópticas específicas.
Também pretendemos desenvolver a síntese de nanopartículas funcionalizadas e biocompatíveis. Nanopartículas fluorescentes podem ser obtidas numa forma hidrofílica com grupos funcionais simples ligados, mas possuindo uma dimensão que lhes permita entrar nas células de sistemas biológicos. Por outro lado, é possível ligar anticorpos que vão permitir estabelecer ligações específicas dentro das células. Através de microscopia fluorescente é possível vêr estas partículas e obter a respectiva imagem. Outras nanopartículas, tais como, de ouro ou magnéticas são também interessantes, as quais apresentam potenciais aplicações em biologia e em química. Contacts and more info.
 

 

  • Unidade de Cristalografia Macromolecular

Macromolecular crystallography (MC) is a most important research area nowadays, providing essential information to many research areas, such as Medicine and Drug Development. As an example, while studying a certain protein target related with a specific disease, the extensive analysis of the protein crystal structure can provide molecular clues for the development of specific drugs which will define novel therapeutic strategies. MC can also have applications on bio- and nanotechnological areas, being important, for instance, for protein design, where starting from a known protein structure, a new molecule is designed by making calculated variations aimed at a specific function. The Macromolecular Crystallography Unit at ITQB is organized into
four different Laboratories: Structural Genomics, Structural Biology, Industry and Medicine Applied Crystallography and Membrane Protein Crystallography. Different projects are currently under way in our unit and the methodologies used can be summarized into five stages: gene cloning, protein expression, purification and crystallization, structure determination, refinement and analysis. For some projects, the target proteins are cloned, expressed and purified within the Unit, whereas for others the purified protein is supplied by other research Laboratories, either from ITQB or outside, within the framework of collaboration projects. Our main goal is to obtain the crystal structure of the protein targets under study, in order to be able to understand the molecular processes in which the proteins take part. Contacts and more info.

 

 

As candidaturas, indicando o(s) laboratório(s) a que se candidata, devem ser enviadas até 15 de Junho para bii@itqb.unl.pt.

Ver regulamento.

Lista de Laboratórios [*PDF]

 

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