Research Projects 2011/12

Master Research Projects 2011/2012

Below you can find a list of Master Research Projects and Research Laboratories available to receive students in 2011/2012.

For applications and further informations, students should contact directly the Laboratory coordinators (please follow the laboratory links for contacts).  When available, the summaries of the research projects are also provided here.

Chemistry Divison

• Scaffolds for synthetic biology [pdf.]
  Bioinorganic Chemistry and Peptide Design Laboratory - Olga Iranzo

• Enantioselective Organocatalysis: Synthesis and Application of Novel Organocatalysts [pdf.] [pt]
  Bioorganic Chemistry Laboratory - Rita Ventura

• Synthesis of compatible solutes with protein thermostabilisation properties [pdf.] [pt] 
  Bioorganic Chemistry Laboratory - Rita Ventura

• Synthesis of DPD and new analogues, the precursor of AI-2, the bacterial signalling molecule for inter-species communication [pdf.]
  Bioorganic Chemistry Laboratory - Rita Ventura

• Sustainable Metal Catalysis based on Iron and Manganese [pdf.]
  Homogeneous Catalysis Laboratory - Beatriz Royo

• Desenvolvimento de quelantes macrocíclicos para complexação de iões metálicos de transição e lantanídeos com interesse em aplicações médicas [pdf.]
  Coordination and Supramolecular Chemistry - Rita Delgado 
• Reconhecimento molecular de aminoácidos por receptores macrobiciclicos heteroditópicos [pdf.]
  Coordination and Supramolecular Chemistry - Rita Delgado
   

Biological Chemistry Divison

• Unidade de Cristalografia Macromolecular [pdf.]
  Metalloenzymes and Molecular Bioenergetics - Maria Arménia Carrondo
• Estudos estruturais da redutase de oxigénio de Entamoeba histolytica [pdf.]
  Metalloenzymes and Molecular Bioenergetics - Célia Romao e Tiago Bandeiras
• Inorganic Biochemistry and NMR Laboratory - Ricardo O. Louro
• Novos mecanismos de resposta ao Stresse Oxidativo [pdf.]
  Metalloenzymes and Molecular Bioenergetics - Miguel Teixeira e Célia Romão
• Functional characterization of haem-copper oxygen reductases [pdf.]
  Metalloproteins and Bioenergetics Laboratory - Miguel S. Teixeira, Manuela M. Pereira
• Membrane Protein Crystallography Laboratory - Margarida Archer
• Modelação molecular/Bioinformática estrutural da hemaglutinina do vírus influenza [pdf.]
  Protein Modelling Laboratory - Cláudio M. Soares
• Modelação molecular/Bioinformática estrutural de citocromo c oxidases [pdf.]
  Protein Modelling Laboratory - Cláudio M. Soares
• Structural and biochemical characterization of novel, Ferrous metabolic pathways in pathogenic bacteria [doc.]
  Biomolecular NMR Laboratory - Manolis Matzapetakis
• Mecanismos de formação de amilóide no ambiente sináptico [pdf.] POSITION FILLED
  Protein Biochemistry Folding & Stability Laboratory- Cláudio M. Gomes
• Study of proteins involved in bacterial resistance
  Molecular Genetics of Microbial Resistance Laboratory - Lígia M. Saraiva
• Novas Enzimas para Aplicações nas áreas da Biodegradação e das Biorefinarias (PT) [.pdf]
  New Enzymes for Biotechnological Applications (EN) [pdf.]
  Microbial & Enzyme Technology Laboratory - Lígia O. Martins 
• Characterization of a new protein purification tag [doc.]
  Analysis of protein‐protein interactions by NMR spectroscopy [doc.]
  Determining the pH structural switch in calbindin D28k [doc.]
  Molecular Interactions and NMR Laboratory - Patrick Groves and/or Malgorzata Palczewska
   

Biology Divison

•  Estratégias de plantas para detectar peptidoglicano bacteriano [pdf.]
  Bacterial Cell Surfaces and Pathogenesis Laboratory - Sérgio R. Filipe e Rita Abranches
• Papel da cápsula de streptococcus pneumoniae no reconhecimento do peptidoglicano pelo sistema imunitário inato do hospedeiro [pdf.]
  Bacterial Cell Surfaces and Pathogenesis Laboratory - Sérgio R. Filipe
• The pneumococcal metabolome in response to different host sugars [pdf.]
  Bacteria & In Vivo NMR Laboratory - Ana Rute Neves
• Interdependency between pyrimidine metabolism and the production of a virulence factor in the human pathogen Streptococcus pneumoniae [pdf.]
  Bacteria & In Vivo NMR Laboratory - Ana Rute Neves
• Structure/function relationships of the major glucose transporter in Lactic Acid [pdf.]
  Bacteria & In Vivo NMR Laboratory - Ana Rute Neves
   

Plant Sciences Divison

• Estratégias de plantas para detectar peptidoglicano bacteriano [pdf.]
  Plant Cell Biology Laboratory - Rita Abranches e Sérgio R. Filipe

• Water deficit responses in two contrasting model plants: Arabidopsis and Thellungiella
  Plant Biochemistry Laboratory - Cândido Pinto Ricardo

• Pesquisa de polifenóis com potencial neuroprotector no modelo da levedura [doc.]
  Disease & Stress Biology Laboratory - Cláudia Nunes dos Santos e Diana Macedo

• Análise proteómica, num modelo celular de neurodegeneração, de extractos vegetais com potencial actividade neuroprotectora [doc.]
  Disease & Stress Biology Laboratory - Cláudia Nunes dos Santos e Marta Alves

• Identificação e caracterização funcional de proteínas que interagem com o factor de transcrição OsEREBP1 de arroz [pdf.]
  Genomics of Plant Stress Laboratory - Nelson Saibo

• Identificação e caracterização de novos factores de transcrição envolvidos na resposta da fotossíntese a condições de seca [pdf.]
  Genomics of Plant Stress Laboratory - Nelson Saibo

• Caracterização do epigenoma de arroz em situações de stress abiótico [pdf.]
  Genomics of Plant Stress Laboratory - Ana Paula Santos e Nelson Saibo

• Impacto de stresses abióticos na remodelação da cromatina e na metilação do DNA [pdf.]
  Genomics of Plant Stress Laboratory - Ana Paula Santos

• Implementation of a LC-MS/MS method for the detection and quantification of multiple plant hormones [doc.]
  Plant Biochemistry Laboratory - Carla Pinheiro e Ana Varela Coelho 

• Quantification of the phytoregulator abscisic-acid (ABA) in chickpea cultivars grown under Mediterranean field conditions [doc.]
  Plant Biochemistry Laboratory - Carla Pinheiro

• Analysis of OsRMC influence on gene expression changes and root mechanosensing in Arabidopsis under jasmonic-acid (JA) [pdf.]
  Genomics of Plant Stress Laboratory - Margarida Oliveira e Tiago Lourenço

• Crosstalk entre processos pós-transcripcionais e pós-traducionais na resposta do arroz a stress de secura [pdf.]
  Genomics of Plant Stress Laboratory - Isabel A. Abreu

• Identificação de genes/proteínas chave que afectam a formação da semente de arroz sob stress salino [pdf.]
  Genomics of Plant Stress Laboratory - Sónia Negrão e Ana Paula Farinha
   

Technology Divison

• Implementação de sistema de detecção por espectroscopia de impedância em canais de microfluídica para caracterização de eritrócitos  [doc.]
  Biomolecular Diagnostics Laboratory - Abel Oliva

• Identificação de factores responsáveis pela regeneração em estrelas‐do‐mar – uma abordagem proteómica [pdf.]
  Mass Spectrometry Laboratory - Ana Varela Coelho

• Preparation of Drug Delivery Systems for Enhanced Bioavailability and Cellular Uptake [doc.]
  Nutraceuticals and Delivery Laboratory - Catarina Duarte

• Preparation of nanoparticulate systems for delivery of neuroprotective compounds to the central nervous system (CNS) [doc.]
  Nutraceuticals and Delivery Laboratory - Catarina Duarte

• Novel drug delivery systems produced using clean technologies with application in inflammatory bowel diseases therapy [pdf.]
  Nutraceuticals and Delivery Laboratory - Catarina Duarte

• Stress by Antibiotics and Virulence of Enterococci Laboratory - Fátima Lopes

• Redirecting AAV vectors for delivery of therapeutic molecules to human basal-like breast cancer cells [pdf.]
  Animal Cell Technology - Paula Alves 

• Novos modelos celulares humanos do sistema nervoso central para avaliação de vectores para terapia génica [pdf.]
  Animal Cell Technology - Paula Alves e Catarina Brito

• Novos modelos celulares de cancro da mama para investigação pré‐clínica [pdf.]
  Animal Cell Technology - Paula Alves

• Image-based optimization of 3D cultures enabling stem cell differentiation to hepatocytes [pdf.]
  Animal Cell Technology - Paula Alves

• Produção de particulas semelhantes a retrovírus como candidatos a vacinas para a Hepatite C [pdf.]
  Animal Cell Technology - Ana Sofia Coroadinha

• Aplicação da genómica funcional na produção de biofármacos virais: vacinas e vectores para terapia génica [pdf.]
  Animal Cell Technology - Ana Sofia Coroadinha

• Produção de cardiomiócitos para terapia celular [pdf.]
  Animal Cell Technology - Paula Alves e Margarida Serra

• Carbon monoxide as a neuroprotective agent against hypoxia-ischemia and reperfusion: apoptosis and autophagy targeting [pdf.]
  Animal Cell Technology - Helena L. A. Vieira

• Engineering Cellular Applications Laboratory - Manuel Carrondo 

• Pharmacokinetics and Biopharmaceutical Analysis Laboratory - Ana Luísa Simplício

• Modelação matemática do período do ritmo circadiano em Neurospora crassa por fosforilações múltiplas na proteína FRQ [pdf.]
  Systems Biodynamics Laboratory - Andreas Bohn

• Selective dissolution of value-added compounds from cork using ionic liquids [doc.]
  Applied and Environmental Mycology Laboratory - Cristina Silva Pereira

• Desenvolvimento de Novos Sistemas para Terapêutica de Oxigénio: Utilização de Líquidos Iónicos Fluorados [doc.]
  Molecular Thermodynamics Laboratory - Isabel M. Marrucho e Ana B. Pereiro

• Purificação de Produtos Activos Farmaceuticos e Enzimas usando de Líquidos Iónicos baseados em vitaminas [doc.]
  Molecular Thermodynamics Laboratory - Isabel M. Marrucho e João M. M. Araújo

• Líquidos Iónicos como meio de aumentar a biodisponibilidade de Produtos Activos Farmaceuticos  [doc.]
  Molecular Thermodynamics Laboratory - Isabel M. Marrucho e João M. M. Araújo

• Brincando com o carácter iónico de líquidos iónicos [doc.]
  Molecular Thermodynamics Laboratory - Isabel M. Marrucho e Ana B. Pereiro

• Novos líquidos iónicos para a separaçao de misturas azeotrópicas [doc.] POSITION FILLED
  Molecular Thermodynamics Laboratory - Isabel M. Marrucho e Ana B. Pereiro

• Implementation of a LC-MS/MS method for the detection and quantification of multiple plant hormones [doc.]
  Mass Spectrometry Laboratory - Carla Pinheiro e Ana Varela Coelho

• Study of Babesia spp infected erythrocytes using nanoparticles (quantum dots) [doc.]
  Biomolecular Diagnostic Laboratory - Abel González Oliva
   

Last updated: 12.07.2011