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Cândido Pinto Ricardo Lab

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The Plant Biochemistry Laboratory has applied transcriptomics, proteomics and metabolomics to study plant development and stress responses. Making use of the information thus gathered and of the recently available genomics data, genes related to proteins shown to be of high relevance to plant development and survival are now being investigated. Another area of interest of the Plant Biochemistry Laboratory concerns science communication to society, activity that is developed in association with the relevant ITQB initiatives.   

Cândido Pinto Ricardo
Professor Catedrático Jubilado
PhD 1968 in Plant Biochemistry
Cambridge University, UK

Phone (+351) 214469654
Extension 1654
ricardo@itqb.unl.pt

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Research Interests

Cork oak (Quercus suber  L.) is an emblematic Portuguese forest tree of high ecological and socio-economic importance but that is under the threat of environmental agents. Considering the need to protect cork oak and the scarcity of knowledge on its biochemical and genetic mechanisms we have been studying the biology of the tree, particularly under the effect of abiotic stress. Since cork is very important for the plant survival as well as a material of high commercial value for Portugal we have been particularly interested in studying the molecular mechanisms of its formation.  The periderm of the potato (Solanum tuberosum) tuber has been used as a model system of suberization. As a result of these studies we were able to identify proteins which have an active participation in cork formation.

Concomitantly, the Plant Biochemistry Laboratory participated in national initiatives aiming to gather information on cork oak genomics. A first project was directed to the sequencing of the cork oak transcriptome (“CorkOakDB”), followed by the Cork oak genome sequencing project (“GenoSuber”), that is now also finished. These two projects provided a substantial amount of information on the genomics of cork oak that we are trying to exploit in order to deepen the knowledge on cork oak biology. We have chosen some of the proteins that we found to be involved in cork formation and are analyzing the nature of the corresponding genes.  

This work is being developed in collaboration with the ITQB laboratories of Prof. Margarida Oliveira and of Dr. Nelson Saibo and the Faculty of Science (UL) laboratory of Prof. Célia Miguel. The bioinformatic support and guidance of Dr. Inês Chaves (Dr. Nelson Saibo Laboratory) is specially acknowledged.

The Plant Biochemistry Laboratory still participates in two other research activities that are a continuation of previous collaborations:

- The coffee/rust biotic interaction, coordinated by Dr. Leonor Guerra-Guimarães (Centro de Estudos da Ferrugem do Café, UL);

- The analysis of the genetic structure of wild plant beet populations, coordinated by Dr. Maria Manuela Veloso (INIAV).

Science Communication

The dissemination of scientific knowledge within the scientific world always was a basic concern of researchers and the transfer of that knowledge to society in an adequate presentation has now become increasingly important.

 Under these perspectives the Plant Biochemistry Laboratory participates in three main initiatives of science communication:

-   In the Infrastructure B4 group “Science Funding, Tech Transfer and Outreach” of The “GREEN-IT Bioresources for Sustainability” Unit;

- In the “Seeds of Knowledge” working group of “Sociedade Portuguesa de Fisiologia Vegetal” in association with Dr. Ana Paula Santos;

- Collaboration with the “ITQB Science Communication Office” in some of its initiatives, namely, “The ITQB Open Day”, “The Fascination of Plants Day” and botanical support to “Câmara Municipal de Oeiras” for the evaluation of the plant diversity existing in the Oeiras County and particularly within the estate of the ITQB/INIAV Campus; it is intended to transmit the information to the general public.

 

Selected Publications

  1. Pinheiro, C., Ribeiro, I.C., Reisinger, V., Planchon, S., Veloso, M.M., Renaut, J., Eichacker, L., and Ricardo, C.P. (2018) Salinity effect on germination, seedling growth and cotyledon membrane complexes of a Portuguese salt marsh wild beet ecotype. Theoretical and Experimental Plant Physiology Doi: 10.1007/s40626-018-0107-4.TXPP-D-17-00273.1

  2. Ramos, A.M., Usié, A., Barbosa, P., Barros, P.M., Capote, T., Chaves, I., Simões, F.,  Abreu, I., Carrasquinho, I., Faro, C., Guimarães, J.B., Mendonça, D., Nóbrega, F., Rodrigues, L., Saibo, N.J.M., Varela, M.C., Egas, C., Matos, J., Miguel, C.M., Oliveira, M.M., Ricardo, C.P. and Gonçalves, S. (2018) The draft genome sequence of cork oak. Scientific Data 5, Article number: 180069 (2018) doi:10.1038/sdata.2018.69

  3. Pinheiro, C., Wienkoop, S., Almeida, J.F., Brunetti, C., Zarrouk, O., Planchon, S., Gori, A., Tattini, M., Ricardo, C.P, Renaut, J. and Teixeira, R.T. (2019) Phellem cell-wall components are discriminants of cork quality in Quercus suber. Front. Plant Sci. 10:944. doi: 10.3389/fpls.2019.00944

 

Laboratory's Website

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Bioquímica Vegetal (PT)

Participação Científica

O Laboratório de Bioquímica Vegetal tem estudado os efeitos adversos do ambiente no comportamento das plantas, essencialmente através de análise proteómica e de expressão genética. Uma planta importante dos nossos estudos tem sido o sobreiro (Quercus suber L.) que é uma árvore emblemática da floresta portuguesa de alta importância ecológica e socioeconómica, todavia altamente ameaçada por agentes ambientais. Temos assim estudado as interacções do sobreiro com o clima e a formação da cortiça que, para além de ser um importante componente de sobrevivência da planta é um produto de alto valor comercial para Portugal.  

Ao estudar os mecanismos moleculares da formação da cortiça, usando inclusivé a periderme do tubérculo de batata (Solanum tuberosum) como sistema modelo de suberização, conseguimos identificar proteínas que têm uma participação activa nesses mecanismos. Entretanto, o Laboratório de Bioquímica Vegetal também participou em iniciativas nacionais com o objetivo de recolher informação sobre a genómica do sobreiro. Um primeiro projeto foi direcionado para a sequenciação do transcriptoma (“CorkOakDB”), seguido pelo projecto de sequenciação do genoma (“GenoSuber”), que agora também está finalizado. Estes dois projectos forneceram uma quantidade substancial de informações sobre a genómica do sobreiro que estamos a tentar explorar, a fim de aprofundar o conhecimento sobre a biologia da planta. Escolhemos algumas das proteínas que verificámos estarem envolvidas na formação de cortiça e estamos analisando a natureza dos correspondentes genes. Este trabalho está sendo desenvolvido em colaboração com os laboratórios do ITQB da Prof. Margarida Oliveira e do Dr. Nelson Saibo e com o laboratório da Faculdade de Ciências (UL) da Prof. Célia Miguel. O apoio e orientação bioinformática do Dr. Inês Chaves (Laboratório do Dr. Nelson Saibo) é especialmente reconhecido.

O Laboratório de Bioquímica Vegetal participa ainda em outras duas atividades de pesquisa que continuam colaborações anteriores:

- A interação biótica café / ferrugem, coordenada pela Dra. Leonor Guerra-Guimarães (Centro de Estudos da Ferrugem do Café, UL);

 - A análise da estrutura genética das populações de beterraba silvestre, coordenada pela Dra. Maria Manuela Veloso (INIAV). 

Comunicação Científica

A disseminação do conhecimento científico no mundo científico sempre foi uma preocupação básica dos investigadores e a transferência desse conhecimento para a sociedade em forma adequada tem-se tornado cada vez mais importante.  Sob essas perspectivas, o Laboratório de Bioquímica Vegetal participa em três iniciativas principais de comunicação científica:

-   No grupo B4 de Infrastructuras “Science Funding, Tech Transfer and Outreach” da Unidade “GREEN-IT Bioresources for Sustainability”;

- No grupo de trabalho “Seeds of Knowledge” da “Sociedade Portuguesa de Fisiologia Vegetal” em associação com a Drª Ana Paula Santos;

- Colaboração com o “ITQB Science Communication Office” em algumas das suas iniciativas, nomeadamente, “Dia Aberto do  ITQb”, “Dia do Fascínio das Plantas” e no apoio botânico à “Câmara Municipal de Oeiras” para avaliação da diversidade de plantas existentes no Município de Oeiras e, em particular, no interior do campus do ITQB / INIAV; pretende-se, subsequentemente, transmitir ao público em geral a informação recolhida.

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