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Nelson Saibo Lab

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In the Plant Gene Regulation Laboratory we use model and crop plants to study gene regulatory mechanisms underlying plant growth and plant responses to adverse environmental conditions

 

      

Nelson Saibo
Investigador Principal
PhD in Science: Biotechnology, 2003, Ghent University (Belgium)

Phone (+351) 214469644
Extension 1644
saibo@itqb.unl.pt

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Research Interests

Global climate changes and a fast growing world population require higher crop production even under adverse environmental conditions. To achieve this goal, we need plants with improved tolerance to abiotic stress and/or increased photosynthesis efficiency. Since these traits of high agronomic impact are both highly regulated at the transcriptional level, it is crucial to better understand their gene regulatory mechanisms. Using rice as a model to study abiotic stress responses in cereal crops and maize as a highly efficient photosynthetic plant (C4 mechanism ), we have been working on the identification and functional characterization of master transcription factors regulating key genes in abiotic stress responses and photosynthesis performance, associated cis- regulatory elements, and related epigenetic modifications (histone & DNA modifications). We are also interested in studying the function of the small RNAs involved in these mechanisms as well as the function of other key players in the signaling pathways associated with abiotic stress responses and photosynthesis performance. The integrative approach we are using will contribute to better understand the molecular mechanisms underlying plant responses to both environmental and developmental cues. The ultimate goal of our research is to identify key players critical to address crop improvement.

 

Group Members

 

  • Paulo Gouveia, Post Doc
  • Tiago Lourenço, Post Doc (co-supervisor)
  • Alicja Gorska, PhD student
  • André Cordeiro, PhD student
  • Diego Almeida, PhD student
  • Joana Rodrigues, PhD student
  • Rita Borba, PhD student
  • Joana Machado, MSc
  • Anna Zimmerman, MSc student (Bayer Crop Science)

 

Selected Publications

  1. Lourenço, T.F., Serra, T.S., Cordeiro, A.M., Swanson, S.J., Gilroy, S., Saibo, N.J.M., and Oliveira, M.M. (2015) The rice E3 ubiquitin ligase OsHOS1 modulates the expression of OsRMC, a gene involved in root mechano-sensing, through the interaction with two ERF transcription factors. Plant Physiology. pp.01131.2015; First Published on September 17, 2015; doi:10.1104/pp.15.01131

  2. Figueiredo, D. D., Barros, P. M., Cordeiro, A. M., Serra, T., Lourenço, T., Chander, S., Oliveira, M. M., Saibo, N. J. M. (2012). Seven Zinc Finger transcription factors are novel regulators of the stress responsive gene OsDREB1B. Journal of Experimental Botany 63(10):3643-56. doi:10.1093/jxb/ers035

  3. Santos, A.P., Serra, T., Figueiredo, D., Barros, P., Lourenço, T., Chander, S., Oliveira, M.M., Saibo, N.J.M (2011). Transcription regulation of abiotic stress responses in rice: a combined action of transcription factors and epigenetic mechanisms. OMICS: A Journal of Integrative Biology 15 (12), 839.


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Regulação Génica em Plantas (PT)

O crescimento da população mundial, em conjunto com as alterações climáticas previstas, exige um aumento da produção agrícola mesmo em situações ambientais menos favoráveis e sem aumentar a área de cultivo. Este objetivo poderá ser atingido através da obtenção de plantas mais tolerantes a condições ambientais adversas (stress) ou de plantas com uma fotossíntese mais eficiente e por isso mais produtivas. Dado que tanto os mecanismos de resposta das plantas ao stress, como os da fotossíntese são altamente regulados ao nível da expressão dos genes envolvidos, o nosso laboratório tem como principal objetivo estudar como se dá essa regulação,, em particular ao nível da transcrição do DNA. Estes estudos estão a ser realizados em duas plantas de cultivo, o arroz que é uma planta altamente sensível a condições ambientais desfavoráveis, nomeadamente frio, secura e salinidade, e o milho que é uma planta muito produtiva por possuir um mecanismo fotossintético altamente eficiente (mecanismo C4). O principal objetivo do laboratório de regulação da expressão génica em plantas é identificar elementos chave que no futuro possam ser utilizados no melhoramento das plantas cultivadas.

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